Deşi medicii s-au mai obişnuit cu prescrierea reţetelor electronice, există totuşi probleme. Aceste nereguli sunt întâlnite de obicei atunci când vine vorba de eliberarea reţetelor pentru nou născuţi. Farmaciştii au fost puşi, de multe ori, în situaţia în care au fost nevoiţi să de-a de urma clienţilor după ce au dat medicamente pe reţete electronice pentru nou născuţi care s-a dovedit că nu figurau în baza de date a CAS şi astfel factura le-a fost refuzată la decontare. Problema a intervenit din cauza neconcordanţelor dintre baza de date a CAS şi cea a medicilor de familie. Aceştia au la dispoziţie 30 de zile pentru a înregistra nou născuţii în baza de date electronică, dar de cele mai multe ori bebeluşii au nevoie de medicamente în primele zile de la naştere.
Nou născuţii nu se regăsesc la CAS